在100年前的日本，存在着一种非灵非怪的生命体——“虫”。当虫附于人身时，就会产生妖异的现象。能够解开虫的秘密，将人治愈的异能者被称为“虫师”。本片的主人公是一位银发独眼的青年虫师——银古（小田切让饰）。
行走四方的银古来到某农庄借宿，他治好了几个单耳失聪的下人。女主人（Lily饰）便请他医治耳聋的孙女真火（守山玲爱饰）。真火的额头上长有四个尖角，虫从角进入一直发出声音，令她无法安宁，而真火的母亲就是死于这种怪病。银古通过和真火聊天找到了病因，成功地引出附在真火身上的虫，让她恢复了正常。
离开真火家，银古来到虫师的聚集地庚申堂，他在那里结识了虫师虹郎（大森南朋饰）。虹郎正在寻找一种形如彩虹名为“虹蛇”的虫，两人结伴同行前往收藏着各种虫的资料的狩房家。狩房家代代被虫附身，但只要用指尖书写虫的故事，虫就能在化作墨的同时消解力量。不料，银古一行达到后却发现狩房家的传人淡幽（苍井优饰）正发着高烧，脚趾上的墨斑已经扩散到了全身。淡幽的奶妈阿玉（李丽仙饰）告诉他们，上月有个银发盲眼的女虫师（江角真纪子饰）来访，淡幽在听她讲述栖息池中的无眼鱼“银虫”之后，就发生了异状。为了帮助淡幽，银古让虫附到了自己身上。淡幽痊愈了，银古却就此变得非常虚弱。在虹郎的一路照顾之下，银古逐渐恢复。虹郎终于找到了虹蛇，银古与之告别再度独自踏上了旅程。
然而，掌握着银古身世秘密的女虫师突然出现在他面前。于是，银古的无尽之旅迎来了终点……