17岁的海老原千波美在感情高涨的时候就会发出电磁波。因为这种能力她从小到大不停的转校。电脑、手机等电子产品一律不能碰，是个苦命的高中生。但她转入吉祥寺某高中后，因心潮澎湃觉得“在新环境要努力”的感受，使得电磁波发射，校内电子机器反应混乱。在千波美偶然经过科学研究部时，实验中的光太郎发现计量器开始不正常波动，这使得他开始关注起千波美，并对千波美发出了“让叔叔为你检查身体”卡。困惑的千波美、认真的光太郎……浆糊双人组诞生了！随着一个个生动活泼的角色陆续登场，围绕在电波娘身边的故事开始越来越精彩了。
